朝まで授業chu!. Cerita ini berkisah tentang Yuuki Kagami, seorang bocah lelaki yang mendaftar di akademi impiannya sebagai siswa berprestasi – dan secara keliru dimasukkan ke asrama perempuan di mana lelaki dilarang. Menghadapi kemungkinan harus meninggalkan sekolah, Yuuki harus berpakaian seperti seorang gadis di asrama. Selain itu, ia akhirnya tinggal bersama guru perempuan Ayana Kakinozaka, yang harus mengawasinya.
